вопросы по конфигу:
- зачем столько коннектов?
- key_buffer_size = 256M при дефолте в 16M
- query_cache_size= 0 при дефолте в 16М
- разные ли таблицы у лса и гса?
при верном ответе на последний вопрос нужно обратить внимание сюда:
innodb_file_per_table
innodb_buffer_pool_size = 1512M
есть все шансы что file_per_table делает и кэш к каждой таблице попутно, но в этом я не уверен.
при этом:
предложу накатить на сервер htop как самый простой способ визуализировать процессы. нужно понять сколько чайлдов плодит mysqld и кто и что из них жрёт.