Если я правильно всё понимаю, я не профи в команд-скриптах, но:
Можете создать батник (.bat файл), в нем пропишете:
C:\Windows\System32\cmd.exe /c start "" /Affinity 1 "C:\Имя папки\l2.exe"
Процессу будет задан cpu0.
Не забудьте указать путь до l2.exe.
Запускать от админа, если вам нужен...